中心围绕草地土壤微生物、植物微生物、动物微生物和系统微生物学理论与技术等四个研究方向，在微生物关键技术、基础理论等前沿领域进行开拓性的交叉研究，探索微生物重大科技问题，为政府决策、草地健康与畜牧业可持续发展提供科学支撑。

中心依托草地农业生态系统国家重点实验室，通过草学、微生物学、分子生物学、畜牧学、生态学、土壤学、生物信息学等学科交叉，将联合美国加州大学伯克利分校、俄克拉荷马大学、斯坦福大学等国外知名高校的优势学科，吸引和引进高层次拔尖人才，组建高水平大团队，培育若干引领未来发展的新方向和新学科，形成一个在国内外具有高度影响力的草地微生物学术高地型科学研究中心。

中心成立于2019年2月，是兰州大学实体性研究机构，也是我国第一个草地微生物研究中心。中国工程院院士南志标出任中心主任。